ATG2A

autophagy related 2A
General Information
Name autophagy related 2A
Alias
  • autophagy-related protein 2 homolog A
  • ATG2 autophagy related 2 homolog A
  • bridge-like lipid transfer protein family member 4A
Synonyms KIAA0404 BLTP4A
Gene_family Autophagy related|MicroRNA protein coding host genes|bridge-like lipid transfer protein family
organism Homo sapiens
entrez_id 23130
location 11q13.1
transcript_count 9
exon_count 41
Cross References
Location
by NCBI GRCh38.p14
    Summary
      Entrez Enables lipid transfer activity. Involved in autophagosome assembly and positive regulation of autophagosome assembly. Is active in organelle membrane contact site. [provided by Alliance of Genome Resources, Mar 2025]
      Stringdb Autophagy-related protein 2 homolog A; Required for both autophagosome formation and regulation of lipid droplet morphology and dispersion; Belongs to the ATG2 family
      nextProt Lipid transfer protein involved in autophagosome assembly (PubMed:28561066, PubMed:31271352, PubMed:30952800). Tethers the edge of the isolation membrane (IM) to the endoplasmic reticulum (ER) and mediates direct lipid transfer from ER to IM for IM expansion (PubMed:31271352, PubMed:30952800). Binds to the ER exit site (ERES), which is the membrane source for autophagosome formation, and extracts phospholipids from the membrane source and transfers them to ATG9 (ATG9A or ATG9B) to the IM for membrane expansion (PubMed:31271352, PubMed:30952800). Lipid transfer activity is enhanced by WIPI1 and WDR45/WIPI4, which promote ATG2A-association with phosphatidylinositol 3-monophosphate (PI3P)-containing membranes (PubMed:31271352). Also regulates lipid droplets morphology and distribution within the cell (PubMed:22219374, PubMed:28561066).
    Interactions
    NCBI
    A A.Source B B.DB B.Source Description PubMed
    ATG2A BioGRID WDR45 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS; Affinity Capture-Western; Co-crystal Structure; Co-localization; Reconstituted Complex
    ATG2A BioGRID TOP3B GeneID BioGRID Affinity Capture-RNA
    ATG2A BioGRID MAP1LC3A GeneID BioGRID Protein-peptide
    ATG2A BioGRID H2AC18 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID RAB7A GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID UBTD1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID RFTN1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID EDEM1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID S100A6 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID ATG10 GeneID BioGRID Phenotypic Enhancement
    ATG2A BioGRID ATG3 GeneID BioGRID Phenotypic Enhancement
    ATG2A BioGRID ATG7 GeneID BioGRID Phenotypic Enhancement
    ATG2A BioGRID RIGI GeneID BioGRID Affinity Capture-RNA
    ATG2A BioGRID RAB9A GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID RAB5C GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID RAB4A GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID RAB3B GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID ARF6 GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID MAP1LC3B GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID H2BC9 GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID OPTN GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID MEOX2 GeneID BioGRID Two-hybrid
    ATG2A BioGRID OTULINL GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID DCAF4 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID HOOK3 GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID HOOK1 GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID DYNC1LI2 GeneID BioGRID Proximity Label-MS
    ATG2A BioGRID VIRMA GeneID BioGRID Affinity Capture-RNA
    ATG2A BioGRID CPEB2 GeneID BioGRID Two-hybrid
    ATG2A BioGRID TRIM25 GeneID BioGRID Affinity Capture-RNA
    ATG2A BioGRID Ewsr1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID TMEM132A GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID WAPL GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID XPO1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID ATG18 GeneID BioGRID Co-localization; Two-hybrid
    ATG2A BioGRID ATG2B GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID WIPI1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID HGH1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID GABARAPL1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID PHB2 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID MAGED2 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID SMC1A GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID DNAJC7 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID DNAJB1 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    ATG2A BioGRID BABAM2 GeneID BioGRID Affinity Capture-MS
    StringDB
    A B experiments database textmining combined score hadb nhadb
    ATG2A EI24 0 0 115 170 1 2
    ATG2A SLC7A9 0 0 0 150 1 1
    ATG2A CPEB2 192 0 0 273 1 1
    ATG2A SLC7A10 0 0 0 158 1 1
    ATG2A MON1B 0 0 71 241 1 1
    ATG2A RIPK2 0 0 66 179 1 1
    ATG2A EHD4 0 0 0 189 1 1
    ATG2A SAE1 0 0 0 150 1 1
    ATG2A PUM2 0 0 0 212 1 1
    ATG2A SNX3 0 0 129 220 1 1
    ATG2A WAPAL 211 0 0 230 1 1
    ATG2A ATAD2 0 0 0 167 1 1
    ATG2A MIB2 0 0 0 272 1 1
    ATG2A KIF3C 0 0 125 276 1 1
    ATG2A LAMP2 0 0 241 261 1 2
    ATG2A PIP5K1A 0 0 0 171 1 1
    ATG2A UBE3C 0 0 0 162 1 1
    ATG2A ACAD11 0 0 53 565 1 1
    ATG2A TMEM173 0 0 44 387 1 1
    ATG2A TAF1 0 0 0 268 1 1
    ATG2A CA6 0 0 0 193 1 1
    ATG2A CCT8 0 0 161 167 1 1
    ATG2A LONP2 0 0 0 294 1 1
    ATG2A SNX1 0 0 0 231 1 1
    ATG2A UBA6 0 0 0 161 1 1
    ATG2A PIK3CG 0 0 74 186 1 1
    ATG2A ULK2 0 800 464 943 1 2
    ATG2A GORASP2 0 0 95 159 1 1
    ATG2A CASP1 0 0 62 153 1 2
    ATG2A COG8 0 0 134 152 1 1
    ATG2A SNAP29 0 0 74 209 1 2
    ATG2A MOCS3 0 0 0 150 1 1
    ATG2A BAG5 241 0 0 247 1 1
    ATG2A RANBP9 0 0 0 248 1 1
    ATG2A EXOC6B 0 0 162 161 1 1
    ATG2A STK38 0 0 0 466 1 1
    ATG2A ULK4 0 0 287 439 1 1
    ATG2A CSNK1E 0 0 0 155 1 1
    ATG2A SQSTM1 0 0 385 505 1 2
    ATG2A BNIP3 0 0 218 238 1 2
    ATG2A ATG13 0 0 503 766 1 2
    ATG2A POLR3C 0 0 144 292 1 1
    ATG2A C21orf59-TCP10L 0 0 0 540 1 1
    ATG2A CLEC16A 0 0 0 211 1 2
    ATG2A VPS13C 0 0 205 498 1 1
    ATG2A TFEB 0 0 181 217 1 2
    ATG2A HSP90AA1 0 0 134 179 1 2
    ATG2A KIF27 0 0 0 200 1 1
    ATG2A PIP5K1B 0 0 0 171 1 1
    ATG2A RFTN1 130 0 48 514 1 1
    ATG2A USP31 0 0 293 343 1 1
    ATG2A GABARAPL1 53 0 468 693 1 2
    ATG2A RAB1A 129 0 74 246 1 2
    ATG2A WDR48 0 0 0 177 1 1
    ATG2A RAB11FIP1 0 0 181 296 1 1
    ATG2A SF3B2 0 0 108 198 1 1
    ATG2A USP6 0 0 0 158 1 1
    ATG2A EPC1 0 0 0 183 1 1
    ATG2A PLEKHF2 0 0 0 218 1 1
    ATG2A TOMM40 0 0 489 489 1 1
    ATG2A AURKA 241 0 0 240 1 2
    ATG2A KIAA1109 0 0 0 183 1 1
    ATG2A CDKN2AIPNL 0 0 255 254 1 1
    ATG2A RAB24 0 0 189 261 1 2
    ATG2A ATG9A 0 0 699 924 1 2
    ATG2A ENSG00000249884 0 0 194 228 1 1
    ATG2A SNX8 0 0 0 231 1 1
    ATG2A USP33 0 0 0 152 1 2
    ATG2A HSPA8 0 0 125 200 1 2
    ATG2A WAC 0 0 181 181 1 1
    ATG2A HSD17B11 0 0 134 152 1 1
    ATG2A MORF4L2 0 0 142 182 1 1
    ATG2A KDELC1 0 0 229 396 1 1
    ATG2A SH3PXD2A 0 0 0 157 1 1
    ATG2A RIC1 0 0 0 154 1 1
    ATG2A RAB9B 0 0 0 240 1 1
    ATG2A DDX58 0 0 0 150 1 1
    ATG2A USP32 0 0 141 215 1 1
    ATG2A SGK494 0 0 0 350 1 1
    ATG2A CNOT4 0 0 103 176 1 1
    ATG2A DCTN3 0 0 170 298 1 1
    ATG2A CUL5 0 0 54 166 1 1
    ATG2A CHMP3 0 0 193 227 1 1
    ATG2A MAP1LC3C 59 0 413 559 1 2
    ATG2A CABP5 0 0 180 179 1 1
    ATG2A DNM2 0 0 82 223 1 1
    ATG2A ATG16L2 0 0 459 615 1 2
    ATG2A BOLA2B 0 0 0 226 1 1
    ATG2A MAP3K11 0 0 0 164 1 1
    ATG2A FANCM 0 0 0 185 1 1
    ATG2A CASP7 0 0 0 186 1 1
    ATG2A VPS8 0 0 0 156 1 1
    ATG2A CSNK1D 0 0 49 162 1 1
    ATG2A CASP8 0 0 112 198 1 2
    ATG2A PIP5K1C 0 0 0 191 1 1
    ATG2A KIF4B 0 0 0 200 1 1
    ATG2A UBOX5 0 0 0 164 1 1
    ATG2A DRAM2 0 0 258 258 1 2
    ATG2A SEC23B 0 0 42 240 1 2
    ATG2A SH3PXD2B 0 0 0 157 1 1
    ATG2A STK35 0 0 0 403 1 1
    ATG2A GAK 0 0 0 162 1 1
    ATG2A SLC25A17 0 0 0 217 1 1
    ATG2A SH3GLB1 0 0 202 289 1 2
    ATG2A TMEM59 0 0 284 284 1 1
    ATG2A ATG4A 0 0 601 872 1 2
    ATG2A ACP2 0 0 123 183 1 1
    ATG2A TBC1D9B 0 0 67 224 1 1
    ATG2A VARS 0 0 0 305 1 1
    ATG2A DNPEP 0 0 0 219 1 1
    ATG2A BPTF 0 0 0 172 1 1
    ATG2A SKIDA1 0 0 218 394 1 1
    ATG2A SPRYD3 0 0 0 248 1 1
    ATG2A SEC23A 0 0 0 239 1 2
    ATG2A ACAD10 0 0 0 227 1 1
    ATG2A USP22 0 0 0 167 1 1
    ATG2A UBE4B 0 0 107 283 1 1
    ATG2A GSKIP 0 0 0 211 1 1
    ATG2A KLRF1 0 0 73 215 1 1
    ATG2A TRAPPC11 0 0 207 207 1 1
    ATG2A HSPA6 0 0 96 192 1 1
    ATG2A IFIH1 0 0 0 150 1 1
    ATG2A PLD1 0 0 0 190 1 1
    ATG2A ATP6V0A2 0 0 90 157 1 1
    ATG2A WRAP53 0 0 88 246 1 1
    ATG2A NSMAF 0 0 0 232 1 1
    ATG2A CENPF 0 0 0 260 1 1
    ATG2A AKNA 0 0 148 221 1 1
    ATG2A KCTD2 0 0 161 218 1 1
    ATG2A VPS39 0 0 0 215 1 1
    ATG2A C21orf59 0 0 181 607 1 1
    ATG2A SYNGR2 0 0 140 163 1 1
    ATG2A KDELR1 0 0 176 232 1 1
    ATG2A UBA1 0 0 0 154 1 1
    ATG2A CTSE 0 0 85 173 1 1
    ATG2A ST13 0 0 71 270 1 2
    ATG2A BOLA2 0 0 0 229 1 1
    ATG2A DHX58 0 0 0 150 1 1
    ATG2A UNK 0 0 0 183 1 1
    ATG2A SEC24C 0 0 116 197 1 1
    ATG2A PIP4K2A 0 0 0 171 1 2
    ATG2A RB1CC1 0 0 520 736 1 2
    ATG2A TMCO3 0 0 213 280 1 1
    ATG2A KIF21B 0 0 0 200 1 1
    ATG2A GPSM3 0 0 246 250 1 1
    ATG2A KIF21A 0 0 0 204 1 1
    ATG2A VPS13B 0 0 0 356 1 1
    ATG2A WDR44 0 0 0 230 1 1
    ATG2A ACOT11 0 0 145 680 1 1
    ATG2A PARK2 0 0 135 170 1 1
    ATG2A IRGM 0 0 392 392 1 2
    ATG2A SLC25A12 241 0 0 240 1 1
    ATG2A CASC5 0 0 0 347 1 1
    ATG2A KLHL21 0 0 161 269 1 1
    ATG2A PIK3CA 0 0 0 157 1 2
    ATG2A GMNC 0 0 143 274 1 1
    ATG2A CTDSP1 0 0 113 206 1 1
    ATG2A DCTN4 0 0 150 297 1 1
    ATG2A DBF4B 0 0 0 159 1 1
    ATG2A UBE4A 0 0 142 403 1 1
    ATG2A HUWE1 0 0 57 225 1 1
    ATG2A FRY 0 0 0 156 1 1
    ATG2A KIF4A 0 0 0 200 1 1
    ATG2A BRD4 0 0 81 179 1 1
    ATG2A KIF7 0 0 0 200 1 1
    ATG2A G3BP2 0 0 0 386 1 1
    ATG2A HDAC6 0 0 150 204 1 2
    ATG2A RAB9A 0 0 0 240 1 2
    ATG2A SNX12 0 0 0 160 1 1
    ATG2A CD300C 0 0 222 222 1 1
    ATG2A PTPN22 0 0 0 165 1 1
    ATG2A FITM2 0 0 217 217 1 1
    ATG2A NAALAD2 0 0 210 259 1 1
    ATG2A PMPCA 0 0 0 181 1 1
    ATG2A LAMTOR4 0 0 162 175 1 1
    ATG2A CFLAR 0 0 81 170 1 1
    ATG2A HTT 0 0 108 161 1 1
    ATG2A LAMP1 0 0 243 295 1 2
    ATG2A MS4A4E 0 0 231 230 1 1
    ATG2A MCAT 0 0 90 174 1 1
    ATG2A CDC42BPG 0 0 193 711 1 1
    ATG2A BCAS3 0 0 0 254 1 2
    ATG2A RAB10 0 0 119 212 1 1
    ATG2A TBC1D13 0 0 205 224 1 1
    ATG2A SLC7A5 0 0 0 158 1 1
    ATG2A RBL1 0 0 0 158 1 1
    ATG2A DDHD2 0 0 45 235 1 1
    ATG2A LMNA 0 0 57 461 1 1
    ATG2A DCTN2 0 0 92 266 1 1
    ATG2A SEC24D 0 0 235 257 1 1
    ATG2A MTMR3 0 0 113 157 1 2
    ATG2A MTOR 0 0 108 302 1 2
    ATG2A PDCD5 0 0 108 267 1 1
    ATG2A MAST1 0 0 0 306 1 1
    ATG2A TRAPPC8 0 0 134 386 1 1
    ATG2A MAN2C1 0 0 0 249 1 1
    ATG2A MYOG 0 0 0 210 1 1
    ATG2A DYNC1LI2 128 0 0 188 1 1
    ATG2A PIRT 0 0 165 165 1 1
    ATG2A RPL9 0 0 99 194 1 1
    ATG2A CLK3 0 0 0 156 1 1
    ATG2A PIK3C3 0 0 517 784 1 2
    ATG2A TRIM7 0 0 153 171 1 1
    ATG2A KIAA1429 270 0 0 270 1 1
    ATG2A RAB5B 0 0 0 170 1 1
    ATG2A IL1B 0 0 82 180 1 1
    ATG2A NAE1 0 0 0 150 1 1
    ATG2A RAB5A 0 0 124 246 1 2
    ATG2A BAG3 0 0 54 188 1 2
    ATG2A POSTN 0 0 0 200 1 1
    ATG2A MRFAP1 0 0 210 210 1 1
    ATG2A PRKAG1 0 0 150 193 1 1
    ATG2A TGFBRAP1 0 0 0 197 1 1
    ATG2A ERBB2IP 0 0 107 453 1 1
    ATG2A SNX18 0 0 234 234 1 2
    ATG2A HGH1 241 0 0 240 1 1
    ATG2A MAP1LC3A 0 0 366 627 1 2
    ATG2A FYCO1 0 0 170 220 1 2
    ATG2A MCPH1 0 0 0 185 1 1
    ATG2A USP27X 0 0 144 348 1 1
    ATG2A TSNARE1 0 0 0 163 1 1
    ATG2A PIK3R4 0 0 459 771 1 2
    ATG2A SMG1 0 0 0 241 1 1
    ATG2A HDAC10 0 0 96 243 1 1
    ATG2A GABARAPL2 59 0 459 651 1 2
    ATG2A ATG14 0 0 562 741 1 2
    ATG2A RAB18 0 0 159 173 1 1
    ATG2A EPC2 0 0 0 183 1 1
    ATG2A WWP1 0 0 72 235 1 1
    ATG2A DBF4 0 0 0 159 1 1
    ATG2A LRSAM1 0 0 142 185 1 2
    ATG2A LONP1 0 0 89 312 1 1
    ATG2A TTC4 241 0 0 260 1 1
    ATG2A TRIP12 0 0 0 249 1 1
    ATG2A ZFC3H1 0 0 0 193 1 1
    ATG2A ZC3H12C 0 0 142 283 1 1
    ATG2A SH3GLB2 0 0 122 259 1 1
    ATG2A MAP1LC3B2 0 0 253 428 1 2
    ATG2A DYNC1LI1 0 0 122 274 1 1
    ATG2A SNX2 0 0 86 267 1 1
    ATG2A LGALS12 0 0 162 161 1 1
    ATG2A SLC2A9 0 0 93 472 1 1
    ATG2A ENSG00000257767 0 0 0 177 1 1
    ATG2A UPF1 0 0 0 185 1 1
    ATG2A PTPN18 0 0 0 165 1 1
    ATG2A MON1A 0 0 90 262 1 1
    ATG2A RAB30 0 0 212 229 1 1
    ATG2A TBC1D2B 0 0 63 178 1 1
    ATG2A RBBP8 0 0 0 436 1 1
    ATG2A NOD1 0 0 86 168 1 1
    ATG2A GNAI3 241 0 0 240 1 2
    ATG2A USP20 0 0 92 304 1 1
    ATG2A PARP2 0 0 57 169 1 1
    ATG2A LRRK2 0 0 113 162 1 2
    ATG2A PRAMEF20 0 0 117 177 1 1
    ATG2A PHB 192 0 0 200 1 1
    ATG2A PIK3CB 0 0 45 160 1 1
    ATG2A C9orf152 0 0 113 174 1 1
    ATG2A USMG5 241 0 0 244 1 1
    ATG2A SNX4 0 0 115 290 1 1
    ATG2A AP1S1 0 0 130 154 1 1
    ATG2A STK38L 0 0 123 680 1 1
    ATG2A BECN1 0 0 503 784 1 2
    ATG2A NUAK2 0 0 112 173 1 1
    ATG2A SLC7A6 0 0 0 158 1 1
    ATG2A EDA2R 0 0 107 244 1 1
    ATG2A INTS1 0 0 0 198 1 1
    ATG2A EHD2 0 0 0 303 1 1
    ATG2A VPS13A 0 0 212 502 1 1
    ATG2A ATG12 0 0 517 767 1 2
    ATG2A UBA2 0 0 0 150 1 1
    ATG2A PTPN5 0 0 0 165 1 1
    ATG2A CASP3 0 0 81 170 1 2
    ATG2A SMURF1 0 0 112 209 1 1
    ATG2A NANOGNB 0 0 108 261 1 1
    ATG2A TMEM259 0 0 0 173 1 1
    ATG2A PLEKHM1 0 0 204 262 1 2
    ATG2A MED26 0 0 127 202 1 1
    ATG2A ATG101 0 0 507 756 1 2
    ATG2A HSPB8 0 0 122 255 1 2
    ATG2A PLD2 0 0 0 190 1 1
    ATG2A ATG4D 0 0 561 764 1 2
    ATG2A PLIN3 0 0 166 171 1 1
    ATG2A PSMD3 0 0 94 163 1 1
    ATG2A GOLGA1 0 0 90 199 1 1
    ATG2A SCRIB 0 0 0 154 1 1
    ATG2A PHB2 242 0 45 253 1 1
    ATG2A C6orf106 0 0 0 221 1 1
    ATG2A PIK3CD 0 0 0 157 1 1
    ATG2A ATG16L1 0 0 604 761 1 2
    ATG2A NOD2 0 0 183 230 1 1
    ATG2A PI4KA 0 0 0 173 1 1
    ATG2A WDR41 0 0 54 223 1 2
    ATG2A CUL3 0 0 74 192 1 1
    ATG2A PI4K2A 0 0 93 172 1 1
    ATG2A PRCC 0 0 116 252 1 1
    ATG2A PTPN12 0 0 0 165 1 1
    ATG2A FRYL 0 0 0 156 1 1
    ATG2A DAP 0 0 170 169 1 2
    ATG2A PTPN20A 0 0 0 165 1 1
    ATG2A TOMM70A 0 0 213 230 1 1
    ATG2A PREB 0 0 0 199 1 1
    ATG2A CTSD 0 0 123 207 1 2
    ATG2A TYRO3 0 0 0 193 1 1
    ATG2A ENSG00000267261 0 0 0 192 1 1
    ATG2A UBE2O 0 0 123 275 1 1
    ATG2A ATG7 0 0 507 772 1 2
    ATG2A SNX30 0 0 0 340 1 1
    ATG2A TAF1L 0 0 59 281 1 1
    ATG2A FMN1 0 0 0 281 1 1
    ATG2A ASPM 0 0 0 272 1 1
    ATG2A MAGEA4 0 0 81 297 1 1
    ATG2A SCAF1 0 0 0 194 1 1
    ATG2A RAB5C 241 0 0 343 1 1
    ATG2A GABARAP 59 0 422 668 1 2
    ATG2A ENSG00000260836 0 0 0 165 1 1
    ATG2A SOGA1 0 0 203 214 1 2
    ATG2A KIAA0226 0 0 245 261 1 1
    ATG2A PI4KB 0 0 0 211 1 1
    ATG2A DDHD1 0 0 45 235 1 1
    ATG2A DNM1L 0 0 57 155 1 2
    ATG2A WIPI1 62 800 865 994 1 2
    ATG2A SRCAP 0 0 0 158 1 1
    ATG2A SLC7A7 0 0 0 158 1 1
    ATG2A UBR3 0 0 134 372 1 1
    ATG2A AMBRA1 0 0 375 414 1 2
    ATG2A TRMT61A 241 0 0 258 1 1
    ATG2A ATAD2B 0 0 0 192 1 1
    ATG2A PTPRG 0 0 0 177 1 1
    ATG2A TMED4 0 0 164 163 1 1
    ATG2A FAM134B 0 0 122 170 1 1
    ATG2A RANBP10 0 0 0 248 1 1
    ATG2A PLIN2 0 0 194 194 1 1
    ATG2A DPM1 0 0 103 197 1 1
    ATG2A CTSB 0 0 134 237 1 2
    ATG2A SMCR8 0 0 48 239 1 2
    ATG2A PDIK1L 0 0 0 403 1 1
    ATG2A PCDH1 0 0 134 188 1 1
    ATG2A OPTN 131 0 261 330 1 2
    ATG2A NIPSNAP1 0 0 108 153 1 1
    ATG2A TIA1 0 0 0 251 1 1
    ATG2A ATG5 0 0 517 772 1 2
    ATG2A TBC1D23 0 0 0 154 1 1
    ATG2A CALCOCO2 0 0 218 234 1 2
    ATG2A MIB1 0 0 0 245 1 1
    ATG2A PTPN1 0 0 0 165 1 1
    ATG2A PUM1 0 0 0 206 1 1
    ATG2A PTPRZ1 0 0 0 165 1 1
    ATG2A AGL 0 0 0 151 1 1
    ATG2A PMPCB 0 0 0 171 1 1
    ATG2A CPEB1 0 0 0 165 1 1
    ATG2A ATG10 0 0 518 755 1 2
    ATG2A VAMP3 0 0 122 202 1 1
    ATG2A ZC3H14 0 0 0 166 1 1
    ATG2A EHBP1 0 0 124 202 1 1
    ATG2A MAP1LC3B 77 0 341 516 1 2
    ATG2A PTPRR 0 0 0 165 1 1
    ATG2A WDFY4 0 0 0 673 1 1
    ATG2A ULK1 0 800 465 945 1 2
    ATG2A NUDC 0 0 222 239 1 1
    ATG2A SETD2 0 0 45 159 1 1
    ATG2A CLK2 0 0 0 156 1 1
    ATG2A SEC61B 241 0 0 240 1 1
    ATG2A PIP4K2C 0 0 0 171 1 1
    ATG2A DYNLL2 0 0 139 335 1 1
    ATG2A PSMD14 0 0 88 188 1 1
    ATG2A SEC23IP 0 0 55 243 1 1
    ATG2A ATG4B 0 0 459 746 1 2
    ATG2A PIK3C2G 0 0 95 204 1 1
    ATG2A RAB7A 0 0 217 514 1 2
    ATG2A DRAM1 0 0 171 171 1 2
    ATG2A ZNF451 0 0 134 152 1 1
    ATG2A FNBP1L 0 0 323 434 1 1
    ATG2A SUPT5H 241 0 0 325 1 1
    ATG2A ESRRB 0 0 62 166 1 1
    ATG2A RAB1B 0 0 180 265 1 2
    ATG2A USP19 0 0 93 287 1 1
    ATG2A UBASH3B 0 0 107 178 1 1
    ATG2A G3BP1 0 0 0 252 1 1
    ATG2A DNAJC7 62 0 74 209 1 1
    ATG2A UVRAG 0 0 298 500 1 2
    ATG2A WDFY3 0 0 170 717 1 2
    ATG2A WDR45 677 0 984 996 1 2
    ATG2A TECPR2 0 0 341 400 1 2
    ATG2A RPAP1 0 0 0 651 1 1
    ATG2A NBR1 0 0 320 630 1 2
    ATG2A MAGED2 241 0 0 259 1 1
    ATG2A VPS11 0 0 167 259 1 2
    ATG2A UQCRC1 0 0 0 171 1 1
    ATG2A USP5 0 0 96 223 1 1
    ATG2A ASCC1 0 0 0 158 1 1
    ATG2A CASP2 0 0 95 674 1 1
    ATG2A ACOT12 0 0 0 292 1 1
    ATG2A HCRTR1 0 0 0 186 1 1
    ATG2A UBL3 0 0 0 179 1 1
    ATG2A CHMP2A 0 0 181 218 1 2
    ATG2A WDR45B 0 0 665 784 1 1
    ATG2A WIPI2 0 800 697 987 1 2
    ATG2A SLC7A11 0 0 0 150 1 1
    ATG2A STIP1 131 0 0 159 1 1
    ATG2A ABHD17A 0 0 0 150 1 1
    ATG2A NFAT5 0 0 60 161 1 1
    ATG2A ZFYVE26 0 0 0 159 1 1
    ATG2A ITCH 0 0 0 176 1 1
    ATG2A USP14 0 0 81 178 1 1
    ATG2A CAPRIN1 0 0 0 410 1 1
    ATG2A TECPR1 0 0 256 322 1 2
    ATG2A PIP5KL1 0 0 0 171 1 1
    ATG2A VPRBP 0 0 0 212 1 1
    ATG2A DNAJB2 0 0 113 285 1 1
    ATG2A SMN2 241 0 0 240 1 1
    ATG2A PTPN2 0 0 118 232 1 2
    ATG2A CWF19L2 0 0 0 167 1 1
    ATG2A SASH1 0 0 0 252 1 1
    ATG2A CLK1 0 0 0 158 1 1
    ATG2A MARCH1 0 0 0 192 1 1
    ATG2A MYCBP2 0 0 0 189 1 1
    ATG2A HELZ2 0 0 0 155 1 1
    ATG2A EHD3 0 0 0 260 1 1
    ATG2A STX8 0 0 128 183 1 2
    ATG2A SLC7A8 0 0 0 158 1 1
    ATG2A CHMP4B 0 0 81 164 1 2
    ATG2A PRKDC 0 0 0 226 1 2
    ATG2A PFDN1 0 0 161 261 1 1
    ATG2A PIK3C2B 0 0 74 190 1 1
    ATG2A FNBP4 0 0 194 244 1 1
    ATG2A WDR6 0 0 164 167 1 1
    ATG2A SPTLC2 241 0 0 259 1 1
    ATG2A EPG5 0 0 266 554 1 2
    ATG2A ATR 0 0 0 157 1 1
    ATG2A PRKAA1 0 0 122 166 1 2
    ATG2A ULK3 0 0 333 624 1 2
    ATG2A FRS3 0 0 138 275 1 1
    ATG2A EEA1 0 0 112 188 1 1
    ATG2A ENSG00000250232 0 0 502 699 1 1
    ATG2A KDM4B 0 0 68 190 1 1
    ATG2A RABEP2 0 0 170 169 1 1
    ATG2A STIL 0 0 0 290 1 1
    ATG2A CHMP7 0 0 212 330 1 1
    ATG2A ATG4C 0 0 495 728 1 2
    ATG2A DNAJB1 61 0 232 409 1 2
    ATG2A ATG3 0 0 501 774 1 2
    ATG2A XPNPEP3 0 0 0 152 1 1
    ATG2A WWP2 0 0 0 209 1 1
    ATG2A KBTBD7 0 0 74 168 1 1
    ATG2A DCAF11 0 0 154 173 1 1
    ATG2A YTHDC2 0 0 0 161 1 1
    ATG2A ATG2B 192 800 812 860 1 2
    ATG2A C20orf24 0 0 193 193 1 1
    ATG2A PTPN7 0 0 0 169 1 1
    ATG2A LYST 0 0 0 270 1 1
    ATG2A UBA3 0 0 0 150 1 1
    ATG2A STX17 0 0 244 396 1 2
    ATG2A RAB11A 0 0 140 218 1 1
    ATG2A MITF 0 0 0 155 1 1
    ATG2A CCZ1 0 0 123 151 1 1
    ATG2A BNIP3L 0 0 210 219 1 2
    ATG2A HCRTR2 0 0 0 186 1 1
    ATG2A PIK3C2A 0 0 73 188 1 2
    ATG2A DDB1 0 0 63 162 1 1
    ATG2A TSC2 0 0 97 178 1 2
    ATG2A GORASP1 0 0 93 155 1 1
    ATG2A TRRAP 0 0 0 205 1 1
    ATG2A RAB7B 0 0 136 316 1 1
    ATG2A RB1 0 0 0 161 1 2
    ATG2A PIP4K2B 0 0 0 171 1 1
    ATG2A ZFYVE1 0 0 456 497 1 2
    ATG2A CLK4 0 0 0 158 1 1
    ATG2A LEUTX 0 0 70 176 1 1
    ATG2A BOLA2-SMG1P6 0 0 0 226 1 1
    ATG2A TGOLN2 0 0 138 177 1 1
    ATG2A UBR1 0 0 0 181 1 1
    ATG2A NDUFAF3 241 0 0 266 1 1
    ATG2A VPS13D 0 0 0 358 1 1
    ATG2A TRAPPC12 0 0 67 162 1 1
    ATG2A UBE3A 0 0 66 197 1 1
    ATG2A SETX 0 0 69 213 1 1
    ATG2A PARP4 0 0 96 192 1 1
    ATG2A UBR4 0 0 94 292 1 1
    ATG2A UBA5 0 0 45 172 1 1
    ATG2A ZNF10 0 0 0 363 1 1
    ATG2A RAE1 0 0 0 263 1 1
    ATG2A LETM1 0 0 103 165 1 1
    ATG2A NOMO2 0 0 0 165 1 1
    ATG2A MARCH8 0 0 0 192 1 1
    ATG2A SNX24 0 0 174 229 1 1
    ATG2A VMP1 0 0 366 513 1 2
    ATG2A UBR2 0 0 95 331 1 1
    ATG2A INO80 0 0 0 505 1 1
    ATG2A EHD1 0 0 81 665 1 1
    ATG2A PINK1 0 0 107 242 1 2
    ATG2A USP3 0 0 83 199 1 1
    ATG2A PTPN23 0 0 0 286 1 1
    ATG2A AXL 0 0 0 159 1 1
    ATG2A BSCL2 0 0 134 231 1 1
    ATG2A PIKFYVE 0 0 66 523 1 1
    ATG2A POLA1 0 0 55 282 1 1
    ATG2A ZC3H3 0 0 0 167 1 1
    ATG2A TGFBI 0 0 0 200 1 1
    ATG2A GBAS 0 0 145 198 1 1
    ATG2A SNX7 0 0 0 340 1 2
    ATG2A VTI1A 0 0 101 212 1 1
    ATG2A UBA7 0 0 0 150 1 1
    ATG2A WDR81 0 0 0 260 1 1
    ATG2A CCZ1B 0 0 122 150 1 1
    ATG2A FANCD2 0 0 0 167 1 1
    Ontologies
    ID Category Term Effect Evidence PubMed
    GO:0120013 Molecular Function lipid transfer activity enables IDA
    GO:0120013 Molecular Function lipid transfer activity enables IMP
    GO:0032266 Molecular Function phosphatidylinositol-3-phosphate binding enables IBA
    GO:0005515 Molecular Function protein binding enables IPI
    GO:0043495 Molecular Function protein-membrane adaptor activity enables IBA
    GO:0000045 Biological Process autophagosome assembly involved_in IBA
    GO:0000045 Biological Process autophagosome assembly involved_in IMP
    GO:0000422 Biological Process autophagy of mitochondrion involved_in IBA
    GO:0061723 Biological Process glycophagy involved_in IBA
    GO:0120009 Biological Process intermembrane lipid transfer involved_in IEA
    GO:0000425 Biological Process pexophagy involved_in IBA
    GO:0034727 Biological Process piecemeal microautophagy of the nucleus involved_in IBA
    GO:2000786 Biological Process positive regulation of autophagosome assembly involved_in IDA
    GO:0010508 Biological Process positive regulation of autophagy involved_in IMP
    GO:0061709 Biological Process reticulophagy involved_in IBA
    GO:0005789 Cellular Component endoplasmic reticulum membrane located_in IEA
    GO:0005811 Cellular Component lipid droplet located_in IEA
    GO:0044232 Cellular Component organelle membrane contact site is_active_in IDA
    GO:0061908 Cellular Component phagophore is_active_in IBA
    GO:0000407 Cellular Component phagophore assembly site is_active_in IBA
    GO:0034045 Cellular Component phagophore assembly site membrane located_in IEA
    Pathways
    Name DB ID
    Alzheimer's disease (WP5124) WikiPathways WP5124_r123917
    Alzheimer's disease and miRNA effects (WP2059) WikiPathways WP2059_r119468
    Neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA) subtypes pathway (WP4577) WikiPathways WP4577_r123500
    Transcripts
    Accession Version MolecularType Name NCBI Comments
    XR_007062462 1 miscRNA transcript variant X3 NC_000011 Reference
    XR_949848 3 miscRNA transcript variant X6 NC_000011 Reference
    XR_949847 3 miscRNA transcript variant X5 NC_000011 Reference
    NM_001367971 1 mRNA transcript variant 2 NC_000011 Reference
    NM_001367972 1 mRNA transcript variant 3 NC_000011 Reference
    NM_015104 3 mRNA transcript variant 1 NC_000011 Reference
    XM_011544863 3 mRNA transcript variant X1 NC_000011 Reference
    XM_011544866 3 mRNA transcript variant X2 NC_000011 Reference
    XM_011544867 4 mRNA transcript variant X4 NC_000011 Reference